Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stra8P70278 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stra8P70278 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra8P70278 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra8P70278 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra8P70278 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra8P70278 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra8P70278 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stra8P70278 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms