Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfixP70257 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NfixP70257 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NfixP70257 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NfixP70257 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NfixP70257 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NfixP70257 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NfixP70257 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NfixP70257 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms