Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NficP70255 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NficP70255 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NficP70255 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NficP70255 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NficP70255 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NficP70255 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NficP70255 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NficP70255 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NficP70255 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NficP70255 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NficP70255 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NficP70255 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NficP70255 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms