Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Crnkl1P63154 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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