Protein–RNA interactions for Protein: P63137

Gabrb2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb2P63137 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrb2P63137 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms