Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx1P63006 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms