Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vsnl1P62761 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vsnl1P62761 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms