Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Rps29P62274 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms