Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp46P62069 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp46P62069 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Usp46P62069 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Usp46P62069 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Usp46P62069 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp46P62069 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp46P62069 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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