Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Siah1aP61092 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Siah1aP61092 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms