Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcbp1P60335 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pcbp1P60335 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms