Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims4P60191 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims4P60191 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims4P60191 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims4P60191 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims4P60191 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims4P60191 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims4P60191 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rims4P60191 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rims4P60191 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms