Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Samsn1P57725 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms