Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gp1bbP56400 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms