Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Atp5eP56382 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms