Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rrp1P56183 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rrp1P56183 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms