Protein–RNA interactions for Protein: P55849

Dsc1, Desmocollin-1, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc1P55849 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms