Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ephb3P54754 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms