Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Rad23aP54726 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms