Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacnb3P54285 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms