Protein–RNA interactions for Protein: P52480

Pkm, Pyruvate kinase PKM, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkmP52480 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PkmP52480 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PkmP52480 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PkmP52480 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PkmP52480 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PkmP52480 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PkmP52480 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PkmP52480 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PkmP52480 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PkmP52480 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PkmP52480 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PkmP52480 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PkmP52480 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PkmP52480 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PkmP52480 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PkmP52480 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PkmP52480 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms