Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RoraP51448 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RoraP51448 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RoraP51448 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RoraP51448 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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