Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MipP51180 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MipP51180 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MipP51180 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MipP51180 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MipP51180 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms