Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa8P50706 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms