Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TspoP50637 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TspoP50637 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TspoP50637 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TspoP50637 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TspoP50637 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TspoP50637 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms