Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc13P50207 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc13P50207 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms