Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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BckdhaP50136 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BckdhaP50136 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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BckdhaP50136 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BckdhaP50136 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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BckdhaP50136 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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