Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms