Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcls1P49710 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms