Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LmnaP48678 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms