Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Abcd1P48410 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcd1P48410 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms