Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Resp18P47939 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms