Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CratP47934 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CratP47934 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CratP47934 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CratP47934 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CratP47934 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CratP47934 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CratP47934 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CratP47934 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CratP47934 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms