Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms