Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klf1P46099 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klf1P46099 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms