Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syt1P46096 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms