Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Mmp9P41245 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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