Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LtbP41155 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LtbP41155 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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LtbP41155 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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LtbP41155 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LtbP41155 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LtbP41155 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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