Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Traf1P39428 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Traf1P39428 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf1P39428 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms