Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lig1P37913 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lig1P37913 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lig1P37913 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms