Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab23P35288 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab23P35288 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms