Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms