Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd1P33215 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nedd1P33215 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms