Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Saa4P31532 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms