Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cd28P31041 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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