Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctnnd1P30999 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctnnd1P30999 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms