Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pabpc1P29341 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms