Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp3P28862 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mmp3P28862 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms