Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RxraP28700 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RxraP28700 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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