Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxd10P28359 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms